​CEK organiseres som en funktion i Klinisk Biokemisk Afdeling, Nordsjællands Hospital i Hillerød med reference til afdelingsledelsen i Klinisk Biokemisk Afdeling. 

CEK ledes af en overlæge (speciallæge i klinisk biokemi). Laboratoriekonsulenter, speciallæger og administrativt personale er fysisk placeret på Nordsjællands Hospital. Laboratoriekonsulenterne er tilknyttet de klinisk biokemiske afdelinger, der indgår i praksisbetjeningen og foretager lægebesøg.​